在Cox实验室,我们以斑马鱼(Danio rerio)为模型系统,研究了胚胎发育、再生和癌症过程中生长的代谢调控。

肝细胞癌(HCC)是最常见的肝癌形式和最致命的癌症类型。华体会软件虽然HCC的病理生理学尚未完全阐明,但该过程在环境因素引起的慢性肝病的范围内清楚地出现,这与致癌途径一起引发肿瘤术。癌症的新兴标志之一是新陈代谢的重新编程。我们的实验室利用了尖端技术,包括多选显微镜,代谢组科,转录组织和化学遗传筛查,以阐明癌症中代谢重编程的分子支撑。

研究项目

肝癌中新陈代谢的转录重编程

肝脏是在组织能量稳态中起关键作用的必要风琴,其作为代谢中心协调消化和营养储存。肝脏表现出动态的代谢可塑性,其通过协调营养状况与适当代谢反应的转录因子完成。在癌症的背景下,出现了致癌转录因子对燃料肿瘤生长的致力学转录因子进行了重新编程的证据。我的实验室主要对两个致癌转录因子,即YAP和NRF2感兴趣。YAP是一种转录的共同活化剂,调节器官生长,作为河马途径的效应,而NRF2是在细胞适应性对氧化应激的关键作用中起关键作用的转录因子。重要的是,已知YAP和NRF2在肝癌中发挥核心作用,但下游机制较差地理解。我们的作品使用Zebrafish(Danio Rerio)作为模型,因为它们的独特属性,如胚胎,高繁殖和具有更高脊椎动物的透明度,促进表型驱动的化学和遗传筛网。我们以前的研究已经利用化学筛网来鉴定NRF2活化刺激肝生长。最近,我们组合新的代谢组和转录组策略,以发现YAP重新编程核苷酸生物合成,以促进癌症的合成代谢生长。向前迈进,我的实验室专注于了解YAP和NRF2如何调节癌症中的代谢。

在这些研究中建立,我们目前有旨在......的研究项目

  • 确定Yap在肝癌中重组脂质代谢的机制。
  • 确定NRF2如何重新编程氨基酸代谢以燃料肝癌。
  • 对Yap和nrf2驱动的肝癌的代谢脆弱性进行精品化学筛选。

肝脏再生过程中代谢的适应性重塑

与大多数人体器官不同,肝脏表现出显着的再生能力。多方刻录肝再生方法,因为它需要由多种细胞类型组成的复杂组织以感测损伤程度并安装适当的补偿性再生回应。然而,尽管研究了几十年的研究,肝脏再生的分子下限很差。因此,需要更好地理解引发肝再生的分子和细胞机制。NRF2是一种转录因子,其在细胞适应压力中起着枢转作用。我们以前发现对肝损伤对NRF2途径的刺激有助于再生。最近,我们在斑马鱼中使用了综合代谢组和转录组种方法,以确定代谢重塑对器官生长的影响程度。我们现在有初步证据表明NRF2在肝损伤后代谢重塑中发挥关键作用,并且是肝再生所必需的。因此,我们是独特的定位,以检查NRF2将代谢物质对燃料肝再生的机制进行检查。该项目将为新的生物问题提供新的见解,其对代谢重塑与组织生长和再生协调的基本生物问题。

在这些研究中建立,我们目前有旨在......的研究项目

  • 确定NRF2在再生期间在适应性代谢重塑中起作用的作用。
  • 描述一种新的斑马鱼损伤模型,该模型再现了慢性肝病。
  • 通过体内成像在细胞水平阐明肝脏再生的动力学。

Anthony Karamalakis,研究助理
Marcos Sande Melón,博士后研究员
陈薇琪博士研究生
Talhah Salmi博士研究生
雅典娜·翁,博士研究生
Tara Tigani,研究助理
Mikaela Wong,荣誉学生
Madeline韦伯,荣誉学生

关键出版物

Salmi TM, Tan VWT,考克斯AG) *(2019)。使用斑马鱼模型来解剖新陈代谢物化学Soc反式。47(1): 305 - 315。*通讯作者。

考克斯AG) *, Tsomides A, Yimlamai D, Hwang KL, Miesfeld J, Galli GG, Fowl BH, Fort M, Ma KY, Sullivan MR, Hosios AM, Snay E, Yuan M, Brown KK, Lien EC, Chhangawala S, Steinhauser ML, Asara JM, Houvras Y, Link B, Vander Heiden MG, Camargo FD, Goessling W(2018)。Yap调节葡萄糖的利用并维持核苷酸的合成以促进器官的生长EMBO J。37(22)。pii: e100294。*共同通讯作者。

考克斯公司,Tsomides A,Kim Aj,Saunders D,Hwang KL,Evason Kj,Huidel J,Brown Kk,Yuan M,Lien Ec,Lee BC,Nissim S,Dickinson B,Chhangawala S,Chang CJ,Asara JM,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras Y,Houvras YVN,Goesling W(2016)。硒蛋白H是氧化还原稳态的重要调节因子,与p53共同参与肿瘤的发生和发展美国国立科学研究院院士。113(38):E5562-71。

考克斯公司, Hwang KL, Brown KK, Evason KJ, Beltz S, Tsomides A, O'Connor K, Galli GG, Yimlamai D, Chhangawala S, Yuan M, Lien EC, wucherpfeneng J, Nissim S, Minami A, Cohen DE, Camargo FD, Asara JM, Houvras Y, Stainier DY, Goessling W(2016)。Yap重组谷氨酰胺代谢以增加核苷酸的生物合成并促进肝脏生长Nat Cell Biol.。18日(8):886 - 96。

考克斯公司Goessling W(2015)。斑马鱼在肝脏研究中的诱惑:肝脏生长发育和再生的调节我的意见是。32:153 - 61。

考克斯公司, Saunders DC, Kelsey PB Jr, Conway AA, Tesmenitsky Y, Marchini JF, Brown KK, Stamler JS, Colagiovanni DB, Rosenthal GJ, Croce KJ, North TE, Goessling W(2014)。亚硝基硫醇信号调节肝脏发育并改善中毒性肝损伤后的预后细胞代表。6(1): 56 - 69。

Rosenbluh J, Nijhawan D,考克斯公司Wang X, Tsherniak A, Schinzel AC, Shao DD, Schumacher SE, Weir BA, Vazquez F, Cowley GS, Root DE, Mesirov JP, Beroukhim R, Kuo CJ, Goessling W, Hahn WC(2012)。β-连环蛋白驱动的癌症需要YAP1转录复合物来维持生存和肿瘤发生细胞。151(7): 1457 - 73。

研究项目

职位可供选择

在上述研究领域,我们提供博士和博士后职位。请联系安德鲁考克斯进一步的信息。